FPGA為資料通訊、電信、無線通訊、消費性電子產品、醫療、工業和軍事市場皆會應用到的系統開發平台。隨著製程技術革新，FPGA也有重大的進展，由0.13μm製程進入到90nm，業者積極縮小線距提高產能，並朝向開發高效能與低耗電技術邁進。
日前Altera發佈的Stratix II系列屬於可修改的FPGA架構，此元件具有自適應邏輯模組(ALM)結構，能突破性能、容量和成本障礙，適合資料儲存、測試儀器和電信設備等高性能應用。Altera採用的邏輯結構消除了過去4個自適應查找表(ALUT)結構固有的性能和效率的權衡問題。一個ALM有多達8個輸入的組合邏輯模組，時序能夠多達2個寬度不同的獨立功能，包括多達6輸入的任意功能和某些7輸入的功能。每個ALM還有2個可編程暫存器、2個專用加法器、1個進位鏈、1個加法樹型鏈和1個暫存器鏈，能有效地利用器件的邏輯容量。同時這個邏輯模組能夠在更小的物理面積上提供更多的邏輯的容量，比以往的FPGA體系所使用的邏輯結構高了2.5倍。
第二代的FPGA架構比第一代Stratix元件效率提高了25%，讓設計者可將功能整合在更小的邏輯面積上、邏輯性能平均提高50%、成本降低40%，同時製程技術革新由0.13μm製程進入到90nm。9層金屬的全銅製程技術採用低K絕緣材料，在300mm晶圓上製造。90nm製造技術和高效架構相結合具有最大的整合度，和以往的大容量架構相比，大大地降低了成本。第一款工程樣品在2004年就可交貨，產品元件可在2005年上半年交貨。
FPGA技術的設計安全性也是在高效能、低耗電與低成本之外要考量的重點，設計安全性高，相對在目前政府機構、軍事以及競爭激烈的商業環境中，就能增加提供需要設計保護需求的市場優勢。Stratix II元件使用128位元密鑰的高級加密標準(AES)演算法對配置的位元流進行加密，此方法的困難點在電路板上還需考量系統故障和冗餘需求，例如，當電池失效時，FPGA將無法供電而造成電路板故障的風險，但在Altera簡化設計之後便無需穩定電源。
製程進步下，元件不斷被要求朝高效能、低耗電而低成本的方向前進，FPGA也持續朝高密度、多功能、低功耗、保密性高與縮小體積發展。尤其是在特殊應用系統的應用市場，FPGA供應商得針對客戶需求，做出符合的設計才是搶下訂單的關鍵。